СТРУКТУРА НДУ "Український науковий центр екології моря"
1. Адміністративно-управлінський апарат
- Директор
- Перший заступник директора
- Заступник директора з науки
- Заступник директора з флоту - Начальник Бази Флоту
- Заступник директора з господарської діяльності
- Заступник директора - начальник МІАЦ
- Учений секретар
2. Сектор юридичний
3. Сектор охорони праці
4. Бухгалтерія
5. Відділ кадрів
6. Відділ документального забезпечення та контролю виконання
7. Адміністративно-господарчий відділ
- сектор експлуатації господарських комплексів
• адміністративний комплекс
• причально-складський комплекс


НАУКОВІ ПІДРОЗДІЛИ
8. Відділ наукових основ морського природокористування, екологічної експертизи та аудиту
- сектор сектор морського природокористування
- сектор дослідження атмосферного забруднення приморських територій
9. Відділ наукових досліджень морського середовища
- сектор гідрофізичних досліджень
- сектор гідробіологічних досліджень
10. Відділ наукових досліджень контактних зон моря
11. Відділ наукових досліджень та охорони морських біоценозів
- сектор біологічних методів оцінки якості морських вод
- сектор охорони морських біоценозів
12. Відділ інформаційного забезпечення наукових досліджень
- сектор розробок інформаційних систем
- сектор бази даних моніторингу Причорноморських країн
13. Відділ аналітичних досліджень та організації моніторингу
- лабораторія радіоекологічних досліджень
- лабораторія хіміко-аналітичних досліджень:
• група гідрохімічних досліджень
• група аналізу забруднюючих речовин
• група хімічних досліджень і організації моніторингу
- сектор гео-екологічних досліджень і організації моніторінгу
- сектор метрологічного забезпечення вимірювань
14. Морський інформаційно-аналітичний центр
- Відділ аналізу морських екосистем
- Відділ гео-інформаційного аналізу
- Відділ аналізу антропогенного навантаження
- Сектор інформаційної підтримки зв`язків з громадкістю


БАЗА ФЛОТУ
15. Береговий підрозділ
16. Науково дослідні судна:
- НДС “Владимир Паршин”
- НДС “Экоконтроль”